המבנה המוניציפלי של ישובים חקלאיים במקור (קיבוצים ומושבים) אשר נוספו להם שכונות של תושבים שאינם חברי האגודה החקלאית, יצר שלל בעיות הדורשות התמחות מיוחדת בנושאי הניהול המוניציפלי של היישוב: וועד מקומי סטטוטורי, אגודה חקלאית, אגודה שיתופית קהילתית ויחסי הגומלין ביניהם. יחסי הגומלין בין התושבים החקלאים לתושבים הלא חקלאים, הקמת אגודה קהילתית בישוב ויחסי הגומלין בינה לבין האגודה החקלאית, זהות הוועד המקומי המנהל את היישוב כרשות מקומית, גבית מסים וכספים אחרים לפעילות הנחוצה ביישוב, וכו'.
שאלות אלה הינן שאלות מעורבות של קנין (בעלות בנדל"ן), חוזים, דיני אגודות שיתופיות, זכויות יסוד, ומעל לכל – שאלות חברתיות/סוציולוגיות רגישות ביותר.
משרדנו נותן ליווי שוטף בנושאים אלה, הן לאגודות השיתופיות החקלאיות ביישוב, הן לוועדים המקומיים והן לאגודות הקהילתיות.
משרדנו מעביר הרצאות בנושאים אלו בקורסי השתלמות למנהלי קהילות ומזכירי ועדים מקומיים.
